επιστήμη

Οι κοροναϊοί συνδέονται στενά με τον πανδημικό ιό που ανακαλύφθηκε στην Ιαπωνία και την Καμπότζη

Ένας coronavirus που σχετίζεται με το SARS-CoV-2 έχει βρεθεί στα πέταλα του Shamel που πέτυχαν στην Καμπότζη το 2010.Πίστωση: Merlin D. Tuttle / SPL

Δύο καταψύκτες εργαστηρίων στην Ασία έχουν προκαλέσει εκπληκτικές ανακαλύψεις. Οι ερευνητές έχουν πει Φύση βρήκαν ένα κοροναϊό που σχετίζεται στενά με το SARS-CoV-2, τον ιό που είναι υπεύθυνος για την πανδημία, σε ρόπαλα πέταλου που έχουν αποθηκευτεί σε καταψύκτη στην Καμπότζη. Εν τω μεταξύ, μια ομάδα στην Ιαπωνία ανέφερε την ανακάλυψη ενός άλλου στενά συνδεδεμένου κορανοϊού – που επίσης βρέθηκε σε κατεψυγμένα περιττώματα νυχτερίδων.

Οι ιοί είναι οι πρώτοι γνωστοί συγγενείς του SARS-CoV-2 που βρίσκονται εκτός της Κίνας, ο οποίος υποστηρίζει τον Παγκόσμιο Οργανισμό Υγείας αναζήτηση σε όλη την Ασία για τη ζωική προέλευση της πανδημίας. Ισχυρές αποδείξεις δείχνουν ότι το SARS-CoV-2 προήλθε από νυχτερίδες πεταλοειδούς πέτρας, αλλά αν πέρασε απευθείας από νυχτερίδες σε ανθρώπους ή μέσω ενός ενδιάμεσου ξενιστή, παραμένει μυστήριο.

Ο ιός στην Καμπότζη βρέθηκε σε δύο νυχτερίδες πέταλου του Σάμελ (Rhinolophus shameliσυνελήφθη στο βόρειο τμήμα της χώρας το 2010. Το γονιδίωμα του ιού δεν έχει ακόμη ολοκληρωθεί η αλληλουχία του – ούτε η ανακάλυψή του δημοσιεύθηκε – καθιστώντας την πλήρη σημασία του για την πανδημία δύσκολο να εξακριβωθεί.

Εάν ο ιός σχετίζεται στενά με – ή ακόμα και πρόγονος – του πανδημικού ιού, θα μπορούσε να παρέχει κρίσιμες πληροφορίες σχετικά με το πώς το SARS-CoV-2 πέρασε από νυχτερίδες σε ανθρώπους και να ενημερώσει την αναζήτηση για την προέλευση της πανδημίας, λέει η Veasna Duong, ιολόγος στο Ινστιτούτο Παστέρ της Πνομ Πενχ, ο οποίος ηγήθηκε της αναζήτησης των παλαιών δειγμάτων στην Καμπότζη και ειδοποίησε Φύση στην ανακάλυψή τους στις αρχές Νοεμβρίου. Για να παράσχει τέτοιες πληροφορίες, ο ιός θα πρέπει να μοιράζεται περισσότερο από το 97% του γονιδιώματός του με το SARS-CoV-2, το οποίο είναι κάτι περισσότερο από τον πιο γνωστό συγγενή του, λένε οι ερευνητές.

Αλλά ο νέος ιός μπορεί να σχετίζεται πιο μακρινά, οπότε, η μελέτη του θα βοηθήσει τους επιστήμονες να μάθουν περισσότερα για την ποικιλομορφία αυτής της οικογένειας ιών, λέει η Etienne Simon-Loriere, ιολόγος στο Ινστιτούτο Pasteur στο Παρίσι, που σκοπεύει να ακολουθήσει ιού, μετά τον οποίο θα κοινοποιηθεί δημόσια.

READ  Οι ηγέτες λένε ότι δεν έχουν προγραμματιστεί νέες παραγγελίες COVID-19, αλλά «παρεμβαίνουν εάν είναι απαραίτητο» - CBS Pittsburgh

Αυτό συμβαίνει με τον άλλο ιό, που ονομάζεται Rc-o319, που εντοπίστηκε σε ένα μικρό ιαπωνικό πέταλο (Rhinolophus cornutus) συλλήφθηκε το 2013. Αυτός ο ιός μοιράζεται το 81% του γονιδιώματός του με το SARS-CoV-2, σύμφωνα με δημοσίευμα1 δημοσιεύθηκε στις 2 Νοεμβρίου – κάτι που το καθιστά πολύ μακρινό για να παρέχει πληροφορίες για την προέλευση της πανδημίας, λέει ο Edward Holmes, ιολόγος στο Πανεπιστήμιο του Σίδνεϊ στην Αυστραλία.

Ανεξάρτητα από το τι βρίσκει η ομάδα της Καμπότζης, και οι δύο ανακαλύψεις είναι συναρπαστικές επειδή επιβεβαιώνουν ότι οι ιοί που σχετίζονται στενά με το SARS-CoV-2 είναι σχετικά συνηθισμένοι Rhinolophus νυχτερίδες, και ακόμη και σε νυχτερίδες που βρίσκονται εκτός της Κίνας, λέει η Alice Latinne, μια εξελικτική βιολόγος στο Wildlife Conservation Society Vietnam στο Ανόι, η οποία έχει δει κάποια ανάλυση της ομάδας της Καμπότζης, αλλά δεν συμμετείχε στην έρευνα.

«Αυτό ψάχναμε και το βρήκαμε», λέει ο Duong. «Ήταν συναρπαστικό και εκπληκτικό ταυτόχρονα.»

Πανδημική προέλευση

Τα ευρήματα δείχνουν επίσης ότι άλλοι συγγενείς SARS-CoV-2 που δεν έχουν ακόμη ανακαλυφθεί θα μπορούσαν να αποθηκευτούν σε καταψύκτες εργαστηρίου, λέει ο Aaron Irving, ερευνητής μολυσματικών ασθενειών στο Πανεπιστήμιο Zhejiang στο Hangzhou της Κίνας, ο οποίος σχεδιάζει επίσης να δοκιμάσει αποθηκευμένα δείγματα νυχτερίδων και άλλων θηλαστικά για αντισώματα κατά του SARS-CoV-2.

«Δεν περίμενα να βρω έναν συγγενή του SARS-CoV-2», λέει ο ιολόγος Shin Murakami στο Πανεπιστήμιο του Τόκιο, ο οποίος ήταν μέλος της ομάδας που αποφάσισε να επανεξετάσει παγωμένα δείγματα ζώων για ιούς μετά την πανδημία.

Μόνο μια χούφτα γνωστών κοροναϊών σχετίζονται στενά με το SARS-CoV-2, συμπεριλαμβανομένου του πλησιέστερου γνωστού σχετικού RaTG13. Ανακαλύφθηκε σε ενδιάμεσες νυχτερίδες πέταλου (Rhinolophus affinis) στην κινεζική επαρχία Γιουνάν το 2013, και δημοσιεύθηκε2 μόνο νωρίτερα φέτος. Υπάρχουν επίσης αρκετοί άλλοι κοροναϊοί, που βρίσκονται σε άλλους Rhinolophus νυχτερίδες και παγκολίνες συνελήφθη μεταξύ του 2015 και του 2019, την οποία οι επιστήμονες γνωρίζουν ότι σχετίζονται στενά με το SARS-CoV-2

READ  Η Γη είναι αιώνια - πιο κοντά στον Ήλιο από οποιαδήποτε άλλη μέρα του χρόνου

«Το SARS-CoV-2 πιθανώς δεν ήταν ένας ολοκαίνουργιος ιός που εμφανίστηκε ξαφνικά. Οι ιοί σε αυτήν την ομάδα υπήρχαν πριν τους γνωρίζουμε το 2019 », λέει ο Tracey Goldstein, αναπληρωτής διευθυντής του One Health Institute στο Πανεπιστήμιο της Καλιφόρνια, Davis, ο οποίος ασχολείται με την ομάδα της Καμπότζης.

Η Latinne λέει ότι οι ανακαλύψεις το επιβεβαιώνουν Rhinolophus νυχτερίδες είναι η δεξαμενή αυτών των ιών.

Ιός στην Καμπότζη

Η ομάδα του Duong συνέλαβε τα νυχτερίδες του πέταλου της Shamel στην Καμπότζη ως μέρος του προγράμματος PREDICT που χρηματοδοτήθηκε από την αμερικανική κυβέρνηση, το οποίο εξέτασε την άγρια ​​ζωή παγκοσμίως για ιούς με πανδημικό δυναμικό για δεκαετίες και έληξε νωρίτερα αυτό το έτος. Τον Απρίλιο, ο Οργανισμός Διεθνούς Ανάπτυξης των ΗΠΑ έδωσε στο πρόγραμμα επιπλέον 3 εκατομμύρια δολάρια και παράταση 6 μηνών για να αναζητήσει στοιχεία για το SARS-CoV-2 σε δείγματα ζώων – κυρίως νυχτερίδες, καθώς και παγκολίνες και άλλα ζώα – που ήταν κάθονται σε καταψύκτες εργαστηρίου στο Λάος, τη Μαλαισία, το Νεπάλ, την Ταϊλάνδη, το Βιετνάμ και την Καμπότζη. Αναμένεται πλήρης έκθεση αυτών των ερευνών τις επόμενες εβδομάδες.

Ο Duong λέει ότι η προκαταρκτική αλληλουχία του γονιδιώματος ενός μικρού τμήματος του νέου ιού νυχτερίδας – 324 ζευγάρια βάσης μακρύ – έδειξε ότι ήταν παρόμοιο με την ίδια περιοχή στα SARS-CoV-2 και RaTG-13, υποδηλώνοντας ότι τα τρία είναι στενά συνδεδεμένα. Αυτή η περιοχή διατηρείται σε μεγάλο βαθμό στους κοροναϊούς, λέει ο Latinne, και χρησιμοποιείται συχνά για να εντοπίσει γρήγορα εάν ένας ιός είναι νέος ή γνωστός. Αλλά δεν είναι ακόμη σαφές εάν το RaTG-13 ή ο νέος ιός σχετίζεται στενότερα με το SARS-CoV-2.

Είναι δύσκολο να πούμε με ένα τόσο μικρό θραύσμα, λέει ο Vibol Hul, ιολόγος επίσης στο Ινστιτούτο Παστέρ της Καμπότζης, ο οποίος παγιδεύει τους νυχτερίδες του πέταλου του Shamel στην είσοδο σε μια σπηλιά το 2010. Τα γονιδιώματα των πιο γνωστών κοροναϊών περιέχουν περίπου 30.000 ζεύγη βάσεων.

READ  Το νοσοκομείο της Βόρειας Γιούτα γεμίζει με την ικανότητα καθώς η Νότια Γιούτα θέτει ένα ακόμη υψηλό 1 ημέρας για περιπτώσεις COVID-19 - St George News

Σε μια ξεχωριστή ανάλυση, η ομάδα της Καμπότζης αλληλούχησε περίπου το 70% του γονιδιώματος του νέου ιού χρησιμοποιώντας την τεχνολογία που διατίθεται τοπικά, λέει ο Erik Karlsson, ιολόγος στο Ινστιτούτο Pasteur στην Καμπότζη, ο οποίος βοήθησε στην ανάλυση των νυχτερίδων. Λείπουν από αυτήν την ακολουθία ήταν οι οδηγίες για κρίσιμα μέρη του ιού, όπως τα γονίδια που κωδικοποιούν την ακίδα πρωτεΐνη που συνήθως χρησιμοποιούν οι κοροναϊοί για να εισέλθουν σε κύτταρα. Η αλληλουχία αυτής της ενότητας θα δείξει εάν αυτός ο ιός μπορεί να μολύνει ανθρώπινα κύτταρα, λέει ο Duong.

Ο νέος ιός θα πρέπει να είναι τουλάχιστον 99% παρόμοιος με το SARS-CoV-2 για να είναι άμεσος πρόγονος του τρέχοντος πανδημικού ιού, λέει ο Irving. Τα γονιδιώματα των RaTG13 και SARS-CoV-2 διαφέρουν μόνο κατά 4%, αλλά αυτή η απόκλιση αντιπροσωπεύει μεταξύ 40 και 70 ετών εξέλιξης από τότε που μοιράστηκαν έναν κοινό πρόγονο. Αν και διαφέρουν δεκαετίες, οι ιοί είναι αρκετά παρόμοιοι για να χρησιμοποιούν τον ίδιο υποδοχέα για είσοδο στα κύτταρα. Μελέτες κυττάρων δείχνουν ότι Το RaTG13 θα μπορούσε να μολύνει άτομα.

Ένας άλλος στενός συγγενής

Από τους γνωστούς κοροναϊούς που σχετίζονται με το SARS-CoV-2, το πρόσφατα ανακαλυφθέν Rc-o319 φαίνεται να είναι το πιο μακρινά, λέει ο Duong.

Σε μελέτες κυττάρων, η ομάδα της Ιαπωνίας διαπίστωσε ότι ο ιός δεν μπορεί να συνδεθεί με τον υποδοχέα που χρησιμοποιεί το SARS-CoV-2 για να εισέλθει σε ανθρώπινα κύτταρα, υποδηλώνοντας ότι δεν θα μπορούσε εύκολα να μολύνει ανθρώπους.

Ο Shin λέει ότι οι συνάδελφοί του συνέλαβαν περισσότερα νυχτερίδες στην Ιαπωνία νωρίτερα αυτό το έτος και σκοπεύουν να τα δοκιμάσουν για κοροναϊούς. Και τον Οκτώβριο, ο Χουλ επέστρεψε στο σπήλαιο στη βόρεια Καμπότζη για να πιάσει περισσότερα νυχτερίδες.

Πιο πιθανώς υπάρχουν περισσότεροι κοροναϊοί που σχετίζονται με το SARS-CoV-2 Rhinolophus πληθυσμοί νυχτερίδων, που ζουν σε όλη την περιοχή, λέει ο Χολμς. «Ας ελπίσουμε ότι ένα ή περισσότερα από αυτά θα σχετίζονται στενά με το SARS-CoV-2 που μπορούμε να το θεωρήσουμε ως τον πραγματικό πρόγονο».

Related Articles

Αφήστε μια απάντηση

Η ηλ. διεύθυνση σας δεν δημοσιεύεται. Τα υποχρεωτικά πεδία σημειώνονται με *

Back to top button
Close
Close